El perfil estratégico del Centro Experimental La Molina, dentro las líneas de acción es la generación de sistemas para la producción en pequeña escala auto subsistencia dentro de los pequeños y grandes agricultores de la zona, de cultivos como el Maíz, leguminosas y cereales que son cultivos de la zona.
Se cuenta con un sistema de crianza de animales menores como: ovinos y cuyes para exportación. .
Se tiene un banco de germoplásma de frutales tales como: Lúcumo, Palto y Chirimoyo, mango y pecano de trascendencia nacional.

Se tiene en la actualidad dentro de los campos e Invernaderos del Centro Experimental La Molina las siguientes actividades de investigación.

Laboratorio de Cultivo de Tejido en papa
Invernadero de papa en la Producción de Tuberculillos libre de Virus

Papa
Se viene propagando plántulas Invitro de diferentes variedades de papa libre de virus dentro del Laboratorio, para luego ser sembrados en los invernaderos y obtener tuberculillos para su propagación y comercialización.

Fresa
Se viene propagando plántulas de fresa libre de virus dentro del Laboratorio, para ser sembrados en los invernaderos y luego ser trasplantados en campo y su posterior comercialización.

Tubos de Ensayo con Plántulas de Fresa Invitro
Multiplicación de Plántulas de Fresa Libre de Virus



Maíz

Orientando principalmente a la producción de semilleros tales como el Marginal 28 T, Chalero INIA y Maíz Pardo


Leguminosas.

Se trabaja en fríjol, tanto en aspecto de manejo agronómico como en la selección y producción de semilleros, en las variedades de Canario 2000, CIFAC 90105 y arveja variedad Usui.


Frutales:

Palto se realiza análisis de Viroide para tener una plantación libre de virus de las variedades Duke, Fuerte y Hass, para ofertar a los agricultores


Cuyes

Se viene trabajando en mejoramiento genético en la nueva Raza Perú.
La cual fue lanzada en el INIEA el año 2004 por la Ing. Lilia Chauca Francia, encargada del Proyecto de Investigación Crianza Cuyes

Ovinos

Determinación de parámetros productivos de los diferentes grados de cruzamiento de ovinos Black Belly y Criollos.

Hortalizas

Para el desarrollo y manejo integrado de plagas y enfermedades, se viene trabajando en la producción de productos orgánicos (Compus, Humus de Lombriz, guano de la isla.)